Una nueva lucha entre Albos y Zorros se protagonizaría en la temporada 1986, pero Cobreloa quedó atrás en las últimas fechas finalizando tercero, equipacion barcelona detrás de Palestino y del campeón Colo-Colo. En 1987 Cobreloa seguiría en un nivel competitivo, aunque terminaría siendo tercero tras el campeón La Universidad Católica y Colo-Colo. Aunque una nueva alegría tendría Cobreloa tras ganar la Copa Chile, en una reñida final de tres partidos frente a Fernández Vial, con triunfo en la ida en Concepción por 1-0, derrota en Calama por 0-2 y triunfo en cancha neutral por 3-0 en el Estadio Regional de Antofagasta, adjudicándose así por primera y única vez este título en su historia.
