En los Juegos Olímpicos de Pekín 2008 en China, Federer volvió a ser el favorito, camiseta del barça pero perdió en los cuartos de final contra James Blake. Federer ganó la Copa Hopman 2001 representando a Suiza, junto con Martina Hingis. Sin embargo, encontró más éxito en la cancha de dobles, capturando la medalla de oro en dobles masculinos con su compatriota Stan Wawrinka, derrotando a Simon Aspelin y Thomas Johansson de Suecia en los Juegos Olímpicos de Verano de 2008, Federer fue el abanderado de Suiza en la Ceremonia de los Juegos Olímpicos.