En la temporada 1999-00, Salva Ballesta se hizo con el Trofeo Pichichi al máximo goleador de la Liga -con 27 goles-. Este fue el primer jugador racinguista en la historia que conseguía dicho trofeo. Independiente eliminó consecutivamente al Santos de Brasil, a un Atlético Nacional que venía de ganar la Libertadores y en semifinales a Argentinos Juniors. Entre 1994 y 1998 Vicente Miera, Marcos Alonso y Nando Yosu consiguieron mantener al Racing en Primera.
